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En septiembre de 1989, los Plenipotenciarios de Colombia, Chile, Ecuador, Panamá y Perú, con ocasión de la Primera Reunión de las Altas Partes Contratantes del Convenio de Lima, suscribieron el Protocolo para la Conservación y Administración de las Áreas Costeras y Marinas Protegidas del Pacífico Sudeste, en el que se reconoce que es necesario adoptar medidas apropiadas para proteger y preservar los ecosistemas frágiles, vulnerables o de valor natural, y la fauna y flora amenazadas por agotamiento y extinción. Dicho Protocolo establece además de la adopción de criterios comunes para el manejo y establecimiento de áreas protegidas en la región, procedimientos para la cooperación, dentro de los cuales, los expertos del Pacífico Sudeste, han recomendado el establecimiento de una Red Regional de Áreas Costeras y Marinas Protegidas, en el marco del Protocolo.

El presente documento fue revisado en la IV Reunión del Grupo Ad-hoc de Expertos sobre  Áreas Marinas y Costeras Protegidas del Pacífico Sudeste, celebrada del 25 al 27 de agosto de 2004 en Guayaquil, Ecuador, con el apoyo del Programa de las Naciones Unidas para el Medio Ambiente – PNUMA, la Secretaría del Convenio sobre Diversidad Biológica – CDB y de la Unión Mundial para la Naturaleza – UICN.